آزمایشگاه مرکزی دانشگاه شهید مدنی آذربایجان با هدف ایجاد بستری مناسب برای ارایه خدمات آزمایشگاهی به محققین دانشگاهی و صنعتی و کاربرد بهینه ظرفیت‌های آزمایشگاهی دانشگاه و تجهیزات و دستگاههای تحقيقاتي در زمينه هاي مختلف آموزشي و پژوهشي دانشگاه و خدمات رساني به موسسات خارج از دانشگاه و با تلاش در جهت افزایش بهره وری و ارتقای توان پژوهشی اساتید و محققین، متمرکز نمودن و ساماندهی امکانات و تجهیزات پیشرفته مورد نیاز رشته های مختلف، بهره وری بهینه از امکانات در دسترس ، ایجاد ارتباط بیشتر در بین پژوهشگران و انتقال اطلاعات و پرهیز از انحصاری شدن دستگاه ها و تجهیزات موجود در سال 1394 راه اندازی گردید. این آزمایشگاه با دارا بودن دستگاه‌های پیشرفته، دقیق و به ‌روز آماده ارائه خدمات علمی-پژوهشی اعم از اندازه‌گیری، تجزیه و تحلیل نتایج داده‌های تجربی و ... به کلیه پژوهشگران و محققین دانشگاه‌های سراسر کشور می‌باشد. دانشگاه شهید مدنی آذربایجان در جهت رفع نیازهای علمی آزمایشگاهی محققین دانشگاه و کشور و تسهیل در فرآیند دستیابی به نتایج آزمایشگاهی مورد نیاز و با هدف افزايش سطح رضايت مراجعان خود از طريق ارائه خدمات آزمايشگاهي با كيفيت، خط مشی زیر را در دستور کار خود قرار داده است :
• استفاده از نيروي انساني مجرب و دارای صلاحیت در آزمايشگاه براي انجام و تحليل آزمايش ها به منظور اطمينان از انجام صحیح و دقیق آنالیزها 
• امکان دسترسی آسان کلیه متخصصین و پژوهشگران کشور به توانمندی‌های آزمایشگاهی
• استانداردسازی آزمون ها، تجهیزات موجود و كالیبراسیون دستگاه ها با به كارگیری اساتید و كارشناسان توانمند در آزمایشگاه ها جهت اطمینان از حصول نتایج صحیح و دقیق در كمترین زمان ممكن
• اعمال رويه حرفه‌اي و متعهد در ارتباط با خدمات ارائه شده به مشتريان
• آشنايي با مستندات كيفيت و بكارگيري كليه روش‌هاي اجرايي در فعاليتهاي مرتبط با محدوده عملكرد آزمايشگاه
• ارائه خدمات پژوهشی و آزمایشگاهی به اعضای محترم هیأت علمی، پژوهشگران و دانشجویان سایر دانشگاه ها و متمركز نمودن و ساماندهی تجهیزات گران قیمت و خرید امكانات پیشرفته مورد نیاز رشته های مختلف
• انعقاد قرارداد با مراکز مختلف علمي و تحقيقاتي دولتی و خصوصی
آزمایشگاه مرکزی دانشگاه شهید مدنی آذربایجان طبق آیین نامه های مشخص برای ارائه خدمات مورد نیاز پژوهشگران دانشگاهی و مراکز صنعتی فعالیت خود را آغاز کرده است. خدمات این آزمایشگاه مشمول تمامي دانشگاه‌ها، موسسات علمي و تحقيقاتي و صنايع مختلف و همچنين بخش خصوصي مي‌باشد و با تعرفه مشخصی که مورد تأیید دانشگاه قرار گرفته است، ارائه می شود. لذا متقاضیان محترم مي‌توانند با مراجعه به آزمايشگاه و يا تماس تلفني از نحوه و ميزان خدمات اين آزمايشگاه مطلع شوند. پایگاه اینترنتی آزمایشگاه مرکزی، اطلاعات لازم در زمینه توانمندی‌ها، برنامه‌ها، دستگاه‌ها و امکانات موجود و همچنین مشخصات کامل آزمایشگاه‌های عضو با دسته‌بندی‌های متنوع در اختیار علاقمندان قرار می‌دهد.